Datasets:
instruction
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61
| input
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34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7119
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.412
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.853
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：178种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7119
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2503
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.309
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：446种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2503
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 1.20%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY01C029
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.20%
- 读数：291,853
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.2%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY01C029
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 ZYQC06-H005 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYQC06-H005
|
根据样本 ZYQC06-H005 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：61,559,436
- 检出物种数：1378
- Shannon多样性指数：5.238
- Simpson多样性指数：0.987
**二、优势菌群**
- Streptococcus mitis (5.6%)
- Streptococcus oralis (4.7%)
- Schaalia odontolytica (4.3%)
- Leptotrichia wadei (3.5%)
- Schaalia meyeri (2.0%)
**三、检出病原体情况**
检出 12 种潜在病原体：
- Fusobacterium nucleatum
- Campylobacter concisus
- Streptococcus pneumoniae
- Porphyromonas gingivalis
- Prevotella intermedia
- Neisseria meningitidis
- Treponema denticola
- Streptococcus pyogenes
- Tannerella forsythia
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Cutibacterium acnes
- Legionella pneumophila
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
ZYQC06-H005
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (5.6%)",
"Streptococcus oralis (4.7%)",
"Schaalia odontolytica (4.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY01D017
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.983
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1320种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY01D017
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6855
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (23.3%)
- Neospora caninum (20.4%)
- Mesomycoplasma hyopneumoniae (18.3%)
- Nesterenkonia natronophila (17.7%)
- Sus scrofa (11.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.865，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：34个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6855
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (23.3%)",
"Neospora caninum (20.4%)",
"Mesomycoplasma hyopneumoniae (18.3%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY05A026
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY05A026
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Aggregatibacter actinomycetemcomitans，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY03D046
|
Aggregatibacter actinomycetemcomitans（伴放线放线杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：1,320
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY03D046
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Aggregatibacter actinomycetemcomitans"
] |
请分析样本 5031 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5031
|
根据样本 5031 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,786,005
- 检出物种数：747
- Shannon多样性指数：4.984
- Simpson多样性指数：0.98
**二、优势菌群**
- Acidovorax temperans (7.4%)
- Brachymonas denitrificans (5.4%)
- Uruburuella suis (5.0%)
- Cloacibacterium caeni (4.5%)
- Moraxella osloensis (3.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5031
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (7.4%)",
"Brachymonas denitrificans (5.4%)",
"Uruburuella suis (5.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5354
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Saccharum hybrid cultivar (16.6%)
- Bradyrhizobium erythrophlei (14.1%)
- Bradyrhizobium liaoningense (2.1%)
- Bradyrhizobium lablabi (1.8%)
- Acinetobacter junii (1.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.564，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：382个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5354
|
overview
|
basic
|
[
"Saccharum hybrid cultivar (16.6%)",
"Bradyrhizobium erythrophlei (14.1%)",
"Bradyrhizobium liaoningense (2.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: LJDX-03-A002
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella melaninogenica (17.0%)
- Actinomadura cremea (7.5%)
- Rothia mucilaginosa (4.4%)
- Prevotella jejuni (3.9%)
- Pan troglodytes (2.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.218，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：760个物种
**关键发现：**
- 检出 10 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
LJDX-03-A002
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (17.0%)",
"Actinomadura cremea (7.5%)",
"Rothia mucilaginosa (4.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 282
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Shigella dysenteriae (15.0%)
- Shigella flexneri (14.7%)
- Escherichia coli (14.6%)
- Shigella sonnei (13.2%)
- Shigella boydii (11.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.69，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：479个物种
**关键发现：**
- 优势菌含潜在致病属（Shigella），需警惕
|
282
|
overview
|
basic
|
[
"Shigella dysenteriae (15.0%)",
"Shigella flexneri (14.7%)",
"Escherichia coli (14.6%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC02-A035
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC02-A035
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3881
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola massiliensis (8.0%)
- Bacteroides ovatus (7.7%)
- Bacteroides kribbi (7.7%)
- Bacteroides xylanisolvens (6.3%)
- Bacteroides uniformis (5.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.782，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：287个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
3881
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola massiliensis (8.0%)",
"Bacteroides ovatus (7.7%)",
"Bacteroides kribbi (7.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1407
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.086
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.958
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：419种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1407
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.39%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC04-A006
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.39%
- 读数：240,980
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC04-A006
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4317
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.935
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.958
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：294种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4317
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1162 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1162
|
根据样本 1162 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：13,702,526
- 检出物种数：319
- Shannon多样性指数：3.649
- Simpson多样性指数：0.951
**二、优势菌群**
- Alloscardovia omnicolens (11.4%)
- Streptococcus parasanguinis (9.7%)
- Schaalia odontolytica (8.3%)
- Mogibacterium diversum (7.4%)
- Actinomyces marseillensis (5.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1162
|
overview
|
basic
|
[
"Alloscardovia omnicolens (11.4%)",
"Streptococcus parasanguinis (9.7%)",
"Schaalia odontolytica (8.3%)"
] |
请分析样本 5236 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5236
|
根据样本 5236 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：630,450
- 检出物种数：414
- Shannon多样性指数：5.303
- Simpson多样性指数：0.99
**二、优势菌群**
- Methylibium petroleiphilum (4.8%)
- Micropruina glycogenica (3.1%)
- Microlunatus phosphovorus (2.9%)
- Skermania piniformis (2.9%)
- Phycicoccus elongatus (2.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5236
|
overview
|
basic
|
[
"Methylibium petroleiphilum (4.8%)",
"Micropruina glycogenica (3.1%)",
"Microlunatus phosphovorus (2.9%)"
] |
请分析样本 2495 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2495
|
根据样本 2495 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：12,645,624
- 检出物种数：362
- Shannon多样性指数：4.374
- Simpson多样性指数：0.975
**二、优势菌群**
- Gemmiger qucibialis (7.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (6.2%)
- Blautia glucerasea (4.5%)
- Blautia schinkii (3.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2495
|
overview
|
basic
|
[
"Gemmiger qucibialis (7.0%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)",
"Fusicatenibacter saccharivorans (6.2%)"
] |
检测到 Aggregatibacter actinomycetemcomitans，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04D003
|
Aggregatibacter actinomycetemcomitans（伴放线放线杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：1,000
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY04D003
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Aggregatibacter actinomycetemcomitans"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1870
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.718
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.93
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：412种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1870
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4174
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides uniformis (8.2%)
- Bacteroides stercoris (5.0%)
- Bacteroides humanifaecis (3.4%)
- Coprococcus comes (2.7%)
- Phocaeicola vulgatus (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.975，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：3287个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4174
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (8.2%)",
"Bacteroides stercoris (5.0%)",
"Bacteroides humanifaecis (3.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYYH06-A002
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Nocardioides agariphilus (7.7%)
- Lysobacter prati (7.4%)
- Ramlibacter humi (4.8%)
- Gluconacetobacter azotocaptans (3.8%)
- Neiella holothuriorum (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.736，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1025个物种
**关键发现：**
- 检出 14 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYYH06-A002
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (7.7%)",
"Lysobacter prati (7.4%)",
"Ramlibacter humi (4.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7347
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.707
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.981
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：716种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7347
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY03A012
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella melaninogenica (4.5%)
- Streptococcus oralis (3.4%)
- Streptococcus mitis (3.2%)
- Gemella haemolysans (2.9%)
- Veillonella atypica (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.215，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：2328个物种
**关键发现：**
- 检出 14 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
JXEY03A012
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (4.5%)",
"Streptococcus oralis (3.4%)",
"Streptococcus mitis (3.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5849
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.474
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.981
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：156种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5849
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4849
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.652
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.987
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：942种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4849
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3453
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.123
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.749
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：280种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3453
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3726
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium breve (27.8%)
- Bifidobacterium bifidum (17.3%)
- Shigella flexneri (6.8%)
- Escherichia coli (6.6%)
- Shigella dysenteriae (6.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.685，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：280个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
3726
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium breve (27.8%)",
"Bifidobacterium bifidum (17.3%)",
"Shigella flexneri (6.8%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ05-A030
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ05-A030
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7708
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.562
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.594
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：134种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
7708
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1244 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1244
|
根据样本 1244 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：45,087,360
- 检出物种数：383
- Shannon多样性指数：4.09
- Simpson多样性指数：0.962
**二、优势菌群**
- Blautia wexlerae (11.2%)
- Anaerostipes hadrus (7.7%)
- [Ruminococcus] gnavus (7.3%)
- Bacteroides koreensis (5.0%)
- Bacteroides kribbi (4.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1244
|
overview
|
basic
|
[
"Blautia wexlerae (11.2%)",
"Anaerostipes hadrus (7.7%)",
"[Ruminococcus] gnavus (7.3%)"
] |
请分析样本 5197 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5197
|
根据样本 5197 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,376,875
- 检出物种数：1237
- Shannon多样性指数：4.56
- Simpson多样性指数：0.961
**二、优势菌群**
- Acinetobacter johnsonii (11.8%)
- Acidovorax temperans (9.8%)
- Moraxella osloensis (8.1%)
- Cloacibacterium caeni (5.3%)
- Cloacibacterium normanense (3.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5197
|
overview
|
basic
|
[
"Acinetobacter johnsonii (11.8%)",
"Acidovorax temperans (9.8%)",
"Moraxella osloensis (8.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: LJDX-01-A009
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella melaninogenica (7.2%)
- Schaalia odontolytica (4.7%)
- Neisseria subflava (4.4%)
- Haemophilus parainfluenzae (4.0%)
- Pan troglodytes (3.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.696，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：954个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
LJDX-01-A009
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (7.2%)",
"Schaalia odontolytica (4.7%)",
"Neisseria subflava (4.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2174
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (34.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (12.4%)
- Phocaeicola plebeius (7.7%)
- Prevotella hominis (4.5%)
- Bacteroides uniformis (1.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.391，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：389个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
2174
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (34.0%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (12.4%)",
"Phocaeicola plebeius (7.7%)"
] |
请分析样本 4342 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4342
|
根据样本 4342 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,788,352
- 检出物种数：255
- Shannon多样性指数：3.325
- Simpson多样性指数：0.912
**二、优势菌群**
- Bacteroides uniformis (23.4%)
- Bacteroides humanifaecis (9.5%)
- Phocaeicola dorei (8.9%)
- Alistipes finegoldii (7.5%)
- Phocaeicola vulgatus (6.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4342
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (23.4%)",
"Bacteroides humanifaecis (9.5%)",
"Phocaeicola dorei (8.9%)"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.29%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06A016
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.29%
- 读数：214,322
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY06A016
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 57
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.915
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.956
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：328种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
57
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC04-A012
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.79
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.983
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1378种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC04-A012
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5719
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.382
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.798
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：263种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5719
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5441 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5441
|
根据样本 5441 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,212,309
- 检出物种数：363
- Shannon多样性指数：5.131
- Simpson多样性指数：0.99
**二、优势菌群**
- Aquabacterium pictum (3.7%)
- Microcoleus vaginatus (3.4%)
- Piscinibacter defluvii (2.7%)
- Tychonema bourrellyi (2.7%)
- Oscillatoria nigro-viridis (2.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5441
|
overview
|
basic
|
[
"Aquabacterium pictum (3.7%)",
"Microcoleus vaginatus (3.4%)",
"Piscinibacter defluvii (2.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: LJDX-02-A010
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.65
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.967
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1218种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
LJDX-02-A010
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.29%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ02-A017
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.29%
- 读数：52,055
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYZJ02-A017
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 5424 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5424
|
根据样本 5424 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：14,175,304
- 检出物种数：1421
- Shannon多样性指数：5.16
- Simpson多样性指数：0.956
**二、优势菌群**
- Sphaerotilus montanus (19.3%)
- Hydrogenophaga aromaticivorans (4.1%)
- Hydrogenophaga taeniospiralis (4.0%)
- Hydrogenophaga flava (2.4%)
- Hydrogenophaga pseudoflava (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5424
|
overview
|
basic
|
[
"Sphaerotilus montanus (19.3%)",
"Hydrogenophaga aromaticivorans (4.1%)",
"Hydrogenophaga taeniospiralis (4.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6821
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (23.0%)
- Neospora caninum (21.7%)
- Nesterenkonia natronophila (19.0%)
- Sus scrofa (18.0%)
- Alteribacter natronophilus (9.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.063，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：122个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6821
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (23.0%)",
"Neospora caninum (21.7%)",
"Nesterenkonia natronophila (19.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1372
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.854
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.955
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：355种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1372
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2529
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides uniformis (6.9%)
- Gemmiger qucibialis (4.8%)
- Collinsella aerofaciens (3.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.7%)
- Methanobrevibacter smithii (2.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.907，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：458个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2529
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (6.9%)",
"Gemmiger qucibialis (4.8%)",
"Collinsella aerofaciens (3.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5234
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.431
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：504种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5234
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC06-A039
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Actinomadura cremea (6.1%)
- Pan troglodytes (5.9%)
- Streptomyces malachitofuscus (4.7%)
- Streptococcus salivarius (3.5%)
- Streptococcus oralis (3.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.714，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：765个物种
**关键发现：**
- 检出 13 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYQC06-A039
|
overview
|
basic
|
[
"Actinomadura cremea (6.1%)",
"Pan troglodytes (5.9%)",
"Streptomyces malachitofuscus (4.7%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.25%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC05-A075
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.25%
- 读数：109,492
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC05-A075
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5955
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.409
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：405种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5955
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.48%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07E031
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.48%
- 读数：112,827
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY07E031
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7631
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.343
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：370种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7631
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.50%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC05-A069
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.50%
- 读数：101,291
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC05-A069
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ06-A029
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ06-A029
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7000
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (24.7%)
- Neospora caninum (24.4%)
- Nesterenkonia natronophila (20.5%)
- Sus scrofa (16.8%)
- Alteribacter natronophilus (6.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.914，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：110个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
7000
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (24.7%)",
"Neospora caninum (24.4%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.5%)"
] |
请分析样本 2601 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2601
|
根据样本 2601 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：10,027,222
- 检出物种数：459
- Shannon多样性指数：4.764
- Simpson多样性指数：0.983
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (5.8%)
- Coprococcus aceti (5.1%)
- Prevotella hominis (4.9%)
- Faecalibacterium hattorii (3.7%)
- Streptococcus thermophilus (2.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2601
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (5.8%)",
"Coprococcus aceti (5.1%)",
"Prevotella hominis (4.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6356
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Gilliamella apicola (26.3%)
- Snodgrassella alvi (20.3%)
- Apis mellifera (14.5%)
- Lactobacillus apis (5.8%)
- Apis cerana (4.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.512，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：87个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6356
|
overview
|
basic
|
[
"Gilliamella apicola (26.3%)",
"Snodgrassella alvi (20.3%)",
"Apis mellifera (14.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 381
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides ovatus (10.1%)
- Bacteroides fragilis (8.6%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (7.2%)
- Blautia wexlerae (5.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.102，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：787个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
381
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides ovatus (10.1%)",
"Bacteroides fragilis (8.6%)",
"Fusicatenibacter saccharivorans (7.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5579
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.493
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.994
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：440种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5579
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY02A032
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌，建议广谱抗菌治疗
- 可选：哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY02A032
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.34%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC06-A026
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.34%
- 读数：207,769
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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ZYQC06-A026
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2072
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (28.7%)
- Prevotella hominis (19.8%)
- Bifidobacterium ruminantium (5.8%)
- Ligilactobacillus ruminis (4.1%)
- Dialister succinatiphilus (3.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.132，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：415个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
2072
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (28.7%)",
"Prevotella hominis (19.8%)",
"Bifidobacterium ruminantium (5.8%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
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样本ID: ZYYH06-A004
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYYH06-A004
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis"
] |
请分析样本 7111 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 7111
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根据样本 7111 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,294,220
- 检出物种数：105
- Shannon多样性指数：1.977
- Simpson多样性指数：0.813
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (26.3%)
- Neospora caninum (21.4%)
- Nesterenkonia natronophila (21.3%)
- Sus scrofa (14.7%)
- Alteribacter natronophilus (5.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7111
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (26.3%)",
"Neospora caninum (21.4%)",
"Nesterenkonia natronophila (21.3%)"
] |
请分析样本 5826 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5826
|
根据样本 5826 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：352,027
- 检出物种数：131
- Shannon多样性指数：4.326
- Simpson多样性指数：0.978
**二、优势菌群**
- Methanolinea mesophila (7.9%)
- Thiobacillus thioparus (7.0%)
- Piscinibacter defluvii (4.0%)
- Sideroxyarcus emersonii (3.4%)
- Sideroxydans lithotrophicus (3.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5826
|
overview
|
basic
|
[
"Methanolinea mesophila (7.9%)",
"Thiobacillus thioparus (7.0%)",
"Piscinibacter defluvii (4.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 4482
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：0.558
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.149
优势度高，少数物种占主导地位
- 物种丰富度：119种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
4482
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2419
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (22.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.4%)
- Coprococcus aceti (2.9%)
- Phocaeicola coprocola (2.7%)
- Roseburia faecis (2.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.289，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：428个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
2419
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (22.3%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.4%)",
"Coprococcus aceti (2.9%)"
] |
请分析样本 7605 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7605
|
根据样本 7605 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：13,970,247
- 检出物种数：508
- Shannon多样性指数：4.533
- Simpson多样性指数：0.975
**二、优势菌群**
- Phocaeicola plebeius (9.4%)
- Akkermansia muciniphila (5.9%)
- Phocaeicola coprocola (4.1%)
- Bacteroides caecigallinarum (4.0%)
- Anas platyrhynchos (3.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7605
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola plebeius (9.4%)",
"Akkermansia muciniphila (5.9%)",
"Phocaeicola coprocola (4.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ03-A027
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.79
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1200种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ03-A027
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6549
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.33
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.845
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：143种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6549
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 ZYZJ03-A004 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYZJ03-A004
|
根据样本 ZYZJ03-A004 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：78,447,884
- 检出物种数：1489
- Shannon多样性指数：4.997
- Simpson多样性指数：0.986
**二、优势菌群**
- Streptococcus salivarius (4.0%)
- Veillonella atypica (3.9%)
- Rothia mucilaginosa (3.5%)
- Schaalia odontolytica (3.5%)
- Veillonella dispar (3.0%)
**三、检出病原体情况**
检出 10 种潜在病原体：
- Campylobacter concisus
- Fusobacterium nucleatum
- Prevotella intermedia
- Treponema denticola
- Neisseria meningitidis
- Tannerella forsythia
- Porphyromonas gingivalis
- Enterococcus faecium
- Cutibacterium acnes
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
ZYZJ03-A004
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus salivarius (4.0%)",
"Veillonella atypica (3.9%)",
"Rothia mucilaginosa (3.5%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
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样本ID: PTC20241228-1
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）- 风险等级：high
- Cutibacterium acnes（痤疮丙酸杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
PTC20241228-1
|
clinical
|
advanced
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[
"Staphylococcus aureus",
"Cutibacterium acnes"
] |
请分析样本 2739 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 2739
|
根据样本 2739 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,608,958
- 检出物种数：438
- Shannon多样性指数：4.75
- Simpson多样性指数：0.983
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (6.5%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.9%)
- Gemmiger qucibialis (3.9%)
- Bacteroides uniformis (3.5%)
- Blautia glucerasea (2.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2739
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (6.5%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.9%)",
"Gemmiger qucibialis (3.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4036
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.988
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.896
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：244种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4036
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC04-A011
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.991
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.982
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1823种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC04-A011
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: PTC20250209-2
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.254
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.927
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：212种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
PTC20250209-2
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1091
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Blautia schinkii (3.4%)
- Phocaeicola vulgatus (3.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.1%)
- Blautia obeum (2.7%)
- Hominisplanchenecus faecis (2.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.959，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：501个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1091
|
overview
|
basic
|
[
"Blautia schinkii (3.4%)",
"Phocaeicola vulgatus (3.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.1%)"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.41%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04B009
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.41%
- 读数：207,502
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
JXEY04B009
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3107
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.031
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.965
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：514种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3107
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2989
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Ruminococcus bromii (23.4%)
- Brotolimicola acetigignens (8.6%)
- Alistipes finegoldii (5.8%)
- Coprococcus aceti (3.3%)
- Anaerostipes hadrus (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.059，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：445个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2989
|
overview
|
basic
|
[
"Ruminococcus bromii (23.4%)",
"Brotolimicola acetigignens (8.6%)",
"Alistipes finegoldii (5.8%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6231
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella ruminicola (78.9%)
- Prevotella brevis (3.8%)
- Fibrobacter succinogenes (1.6%)
- Prevotella aff. ruminicola Tc2-24 (1.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.276，表明菌群多样性较低
- 物种丰富度：123个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
6231
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella ruminicola (78.9%)",
"Prevotella brevis (3.8%)",
"Fibrobacter succinogenes (1.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4763
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Ustilago hordei (51.3%)
- Cutibacterium acnes (3.4%)
- Lolium perenne (1.9%)
- Streptopelia turtur (1.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.172，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：312个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4763
|
overview
|
basic
|
[
"Ustilago hordei (51.3%)",
"Cutibacterium acnes (3.4%)",
"Lolium perenne (1.9%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.25%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYQC06-A070
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.25%
- 读数：179,200
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC06-A070
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1454
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.587
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.979
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：445种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1454
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5712 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5712
|
根据样本 5712 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：55,224
- 检出物种数：66
- Shannon多样性指数：3.032
- Simpson多样性指数：0.889
**二、优势菌群**
- Desulfosporosinus fructosivorans (28.1%)
- Desulfosporosinus metallidurans (12.2%)
- Ralstonia pickettii (7.9%)
- Cutibacterium acnes (5.7%)
- Actinotalea fermentans (5.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5712
|
overview
|
basic
|
[
"Desulfosporosinus fructosivorans (28.1%)",
"Desulfosporosinus metallidurans (12.2%)",
"Ralstonia pickettii (7.9%)"
] |
请分析样本 5568 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5568
|
根据样本 5568 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：5,961,714
- 检出物种数：1228
- Shannon多样性指数：5.062
- Simpson多样性指数：0.926
**二、优势菌群**
- Sphingobium limneticum (26.6%)
- Sphingorhabdus lacus (4.1%)
- Aquabacterium pictum (1.1%)
- Hydrogenophaga pseudoflava (1.1%)
- Hydrogenophaga flava (1.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5568
|
overview
|
basic
|
[
"Sphingobium limneticum (26.6%)",
"Sphingorhabdus lacus (4.1%)",
"Aquabacterium pictum (1.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6550
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.491
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.853
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：216种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6550
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5596
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.518
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.981
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：880种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5596
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4709
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：6.533
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.996
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1771种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4709
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6107
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Alteromonas macleodii (18.5%)
- Vibrio campbellii (10.0%)
- Alteromonas marina (4.5%)
- Pseudoalteromonas elyakovii (4.3%)
- Sphingobium naphthae (4.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.76，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：184个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
6107
|
overview
|
basic
|
[
"Alteromonas macleodii (18.5%)",
"Vibrio campbellii (10.0%)",
"Alteromonas marina (4.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6963
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.737
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.781
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：52种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6963
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 4550 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4550
|
根据样本 4550 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：15,694,361
- 检出物种数：1983
- Shannon多样性指数：5.326
- Simpson多样性指数：0.976
**二、优势菌群**
- Acidovorax temperans (11.1%)
- Acinetobacter johnsonii (7.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.8%)
- Trichococcus flocculiformis (3.0%)
- Uruburuella suis (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4550
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (11.1%)",
"Acinetobacter johnsonii (7.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.8%)"
] |
请分析样本 4478 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4478
|
根据样本 4478 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,444,841
- 检出物种数：8166
- Shannon多样性指数：1.944
- Simpson多样性指数：0.388
**二、优势菌群**
- Prochlorococcus marinus (78.2%)
- Sphingomonas ginsenosidimutans (2.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
4478
|
overview
|
basic
|
[
"Prochlorococcus marinus (78.2%)",
"Sphingomonas ginsenosidimutans (2.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6764
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.626
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.872
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：148种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6764
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 792
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.393
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.925
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：348种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
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792
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interpretation
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intermediate
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[] |
检测到 Prevotella intermedia，丰度为 0.34%，请评估其临床意义。
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样本ID: JXEY04C016
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Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.34%
- 读数：205,769
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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JXEY04C016
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pathogen
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intermediate
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[
"Prevotella intermedia"
] |
请分析样本 4482 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 4482
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根据样本 4482 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,301,063
- 检出物种数：119
- Shannon多样性指数：0.558
- Simpson多样性指数：0.149
**二、优势菌群**
- Prochlorococcus marinus (92.2%)
- Sphingomonas ginsenosidimutans (1.7%)
- Croceibacter atlanticus (1.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
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4482
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overview
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basic
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[
"Prochlorococcus marinus (92.2%)",
"Sphingomonas ginsenosidimutans (1.7%)",
"Croceibacter atlanticus (1.0%)"
] |
请分析样本 6550 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 6550
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根据样本 6550 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,923,350
- 检出物种数：216
- Shannon多样性指数：2.491
- Simpson多样性指数：0.853
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (23.4%)
- Nesterenkonia natronophila (19.2%)
- Neospora caninum (16.3%)
- Sus scrofa (15.4%)
- Alteribacter natronophilus (4.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
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6550
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overview
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basic
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[
"Parvularcula marina (23.4%)",
"Nesterenkonia natronophila (19.2%)",
"Neospora caninum (16.3%)"
] |
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in Data Studio
🦠 Csv Analysis Qa
Microbiology QA from real CSV detection reports (24K samples)
📊 Dataset Statistics
| Split | Samples |
|---|---|
| Train | 21,622 |
| Validation | 1,201 |
| Test | 1,202 |
| Total | 24,025 |
📝 Data Format
{
"instruction": "Question or instruction",
"input": "Optional context",
"output": "Answer or response",
"source": "Data source",
"category": "Category label"
}
📦 Usage
from datasets import load_dataset
dataset = load_dataset("xingqiang/microbiology-csv-analysis-qa")
print(f"Training samples: {len(dataset['train']):,}")
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📅 Info
- Date: December 2024
- Project: DeepMicroPath
- License: Apache 2.0
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